En l'an 10191, dans une galaxie lointaine composée de quatre planètes principales : Kaitan, qui abrite l'empereur Shaddam IV, maître absolu de l'univers ; la verdoyante Caladan, où demeure le clan des Atréides commandé par le duc Leto ; Giedi Prime, fief des Harkonnen, ennemis jurés des Atréides ; et Arrakis, surnommée 'Dune', monde désertique habité par les mystérieux Fremen et dont le sous-sol recèle la précieuse Epice, qui permet de voyager à travers le temps et l'espace. Cette dernière est bientôt le théâtre d'un nouvel épisode de la lutte entre les hommes du duc Leto et ceux du terrible baron Vladimir Harkonnen, qui a conclu un pacte avec l'empereur pour anéantir les Atréides. Mais c'est compter sans les pouvoirs et le destin messianique de Paul, le fils de Leto...